La commune est située dans le bassin de Seine Normandie. Elle est drainée par le Thérain, et divers bras et dérivations du Thérain[.
Le Thérain, d’une longueur de 94 km, prend sa source dans la commune de Gaillefontaine et se jette dans l’Oise, après avoir traversé 43 communes[. Les caractéristiques hydrologiques du Thérain sont données par la station hydrologique située sur la commune de Beauvais. Le débit moyen mensuel est de 5,45 m3/s[. Le débit moyen journalier maximum est de 37 m3/s, atteint lors de la crue du . Le débit instantané maximal est quant à lui de 39,8 m3/s, atteint le [.
En bas du village le bras principal de la rivière constitue la limite territoriale entre la commune de Troissereux et celle de Fouquenies. La rivière principale y alimentait une scierie. Les autres canaux et dérivations ont été aménagés portant le nom de « Rivière Neuve » par le Seigneur de Troissereux, pour alimenter le moulin à blé qui fût en activité jusqu’en 1935.
La baignade est interdite dans les étangs et la rivière, ces plans d’eau ne sont pas aménagés ni surveillés, et présentent des dangers réels ( Profondeur variable, courants, végétation aquatique, absence de secours de proximité)
